Anaerobe Bakterien sind Bakterien, die in sauerstoffarmen Umgebungen (z. B. tief in den Furchen der Zunge oder im Rachenraum) leben. Im menschlichen Körper befinden sich viele Arten anaerober Bakterien, deren Aufgabe es ist, die verschiedensten Körperfunktionen zu unterstützen. So gibt es z. B. anaerobe Bakterien, die durch die Bildung spezieller chemischer Stoffe die Verdauung von Eiweiß fördern. Da diese Bakterien anaerob sind, also eine Umgebung bevorzugen, die arm an Sauerstoff ist, werden sie in solchen Situationen besonders aktiv.
Dies ist z. B. der Fall, wenn der Mund trocken wird, also weniger Sauerstoff enthält. Es stellte sich heraus, dass diese anaeroben Bakterien vermehrt bei Menschen zu finden sind, die unter Mundgeruch leiden. Warum dies so ist, ist leider noch nicht bekannt. Da anaerobe Bakterien dieser Art aber ein wichtiger Teil des Körpers sind, können und sollen sie nicht vollständig ausgerottet werden. Abgesehen davon leben anaerobe Bakterien tief in den Fasern der Zunge und nicht auf der Zungenoberfläche und können deshalb auch nicht durch eine verstärkte Mundhygiene beseitigt werden.
